Agora estou a perceber; tu queres uma amostragem aleatória sem reposição, que no teu caso acaba por ser um shuffle da sequência original. Se calhar eu começaria por gerar então uma lista com os 9 números numa ordem aleatória, e depois trataria de os duplicar e partir em sublistas.
Lê um pouco sobre a função random.shuffle() como ponto de partida (também podes ver random.sample() para uma solução mais genérica)
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