Ajuda em gestão de aplicação web

Boa tarde,

Estou a desenvolver uma aplicação web, estando já praticamente pronta para colocar em modo produção, no entanto ao longo do tempo irá sofrer vários updates de módulos que ainda estou a desenvolver.
O ambiente de desenvolvimento será maioritariamente windows e o de produção linux.

Agora as questões em que gostaria que me ajudassem:

1. Neste momento estou a preparar o servidor, tendo já instalado o Ubuntu Server 12.04 LTS. Escolhi ubuntu em detrimento do CentOS devido a estar mais familiarizado com debian, acham que é fiável para a função? E LAMP, recomendam? (obs: a aplicação será utilizada em ambiente empresarial por cerca de 250 pessoas diariamente)

2. Que ferramentas me aconselham para manter o ambiente de produção atualizado?
Nota: Já utilizo Git para controlo de versões em ambiente de desenvolvimento.

3. Alguma GUI MySQL que recomendem?


Obrigado e cumprimentos,
Chester